Cuando escuchas estas cosas es cuando te quedas de piedra,
En éste video hablando del WP, Craig dice algo que tengo que consultarle a un técnico pues no tengo conocimiento como para evaluarlo como es debido, pero si es así como lo cuenta es simplemente acojonante:

Dice algo así :
"Si quisieras tener bloques de un mega,(tal y como lo desean los de Core), no haría falta la estructura del árbol de Merkle, porque para bloques de un mega añadir esto lo hace mas ineficiente y menos seguro, un hash de un hash es menos seguro que un solo hash"

Lo que vengo a entender es que se le incluyó el árbol de Merkle, porque la idea original no era dejar los bloques en 1Mb de tamaño, sino que el árbol de Merkle está en la estructura para garantizar la robustez de los datos a medida que aumenta el tamaño de los bloques y por tanto la escalabilidad.

Minute 29:40. (1h24)
"If you want to keep 1 Mb block, you don't need merkle trees, because it's less efficient and less secure, a hash of a hash is less secure than a single hash".

"5. The Third Section: Timestamp Server - The Bitcoin White Paper - CSW & RXC" en YouTube
https://youtu.be/CojHv3YhUnk