معضل بوی تعفن فاضلابهای شهری و مسائل بهداشتی ناشی از آن سالهاست گریبانگیر مردم گنبدکاووس است. این مشکل قرار بود با اجرای طرح ملی جمع آوری فاضلاب در دهه ۷۰ رفع شود، اما پیشرفت فیزیکی این طرح هنوز به ۴۰ درصد نرسیده و در این شرایط مردم خواستار راهکار دیگری برای رفع این معضل هستند. هدایت فاضلاب خانگی به کوچه و معابر، در کنار نبود پستی و بلندی طبیعی در خیابانها، جداول و کانالهای هدایت آب شهر، گنبدکاووس را به منبعی از بوی تعفن تبدیل کرده که این مشکل چندین ساله در روزهای گرم سال، شهروندان را بیش از همیشه آزار میدهد.